โหมดการทำงานแรก: การเคลื่อนที่เป็นวงกลมของมอเตอร์ผ่านอุปกรณ์กลไก ทำให้ไดอะแฟรมภายในปั๊มตอบสนอง บีบอัดและยืดอากาศภายในห้องปั๊มเพื่อสร้างแรงดันลบ ความแตกต่างของความดันจะถูกสร้างขึ้นที่ช่องดูดเมื่อเปรียบเทียบกับความดันบรรยากาศภายนอก ภายใต้อิทธิพลของความแตกต่างของความดันนี้ ก๊าซจะถูกดึงเข้าไปในห้องปั๊มแล้วระบายออกจากช่องไอเสีย
โหมดการทำงานที่สอง: ปั๊มไดอะแฟรมขนาดเล็กใช้การหมุนของสกรูเพื่อดึงและปล่อยของเหลว สกรูกลางของปั๊มไดอะแฟรมขนาดเล็กคือสกรูขับที่ขับเคลื่อนโดยตัวขับเคลื่อนหลัก ในขณะที่สกรูด้านนอกสองตัวเป็นสกรูขับเคลื่อน โดยหมุนในทิศทางตรงกันข้ามกับสกรูขับเคลื่อน ทั้งสกรูตัวขับและสกรูตัวขับมีเกลียวคู่- เนื่องจากการต่อกันของสกรูและการขันแน่นระหว่างสกรูและผนังด้านในของบุชชิ่ง จึงมีการสร้างช่องว่างที่ปิดผนึกอย่างน้อยหนึ่งช่องระหว่างช่องดูดและช่องระบายของปั๊มไดอะแฟรมขนาดเล็ก ขณะที่สกรูหมุนและเป็นตาข่าย พื้นที่ที่ปิดผนึกเหล่านี้จะเกิดขึ้นอย่างต่อเนื่องที่ปลายด้านดูดของปั๊ม เพื่อปิดผนึกของเหลวไว้ในห้องดูดด้านใน จากนั้นของเหลวจะถูกผลักอย่างต่อเนื่องจากห้องดูดไปตามแกนสกรูไปจนถึงปลายระบาย โดยปล่อยของเหลวที่อยู่ในแต่ละช่องอย่างต่อเนื่อง ซึ่งคล้ายกับการดันน็อตไปข้างหน้าอย่างต่อเนื่องในขณะที่สกรูหมุน นี่คือหลักการทำงานพื้นฐานของปั๊มไดอะแฟรมขนาดเล็ก